Microbiología Ambiental y Biodegradación

Objetivos generales

Los microorganismos juegan un papel importante en su entorno y contribuyen al metabolismo de todo tipo de compuestos, con consecuencias importantes en el funcionamiento y mantenimiento de los ecosistemas. Nuestro grupo investiga las interacciones de las bacterias con su entorno, y especialmente aquellas interacciones que resultan beneficiosas para el ecosistema, con el objetivo final de explotar las actividades y capacidades microbianas en diferentes aplicaciones biotecnológicas. Utilizando aproximaciones multidisciplinarias como la microbiología, la biología molecular, la biología estructural y la bioquímica de proteínas, buscamos entender las bases moleculares de estas actividades mediante dos líneas principales de investigación:

  • Estudiar los procesos relevantes en la interacción de las bacterias con su entorno, tales como quimiotaxis, motilidad, formación de biopelículas (biofilms), y señalización celular.
  • Mejorar las capacidades de biodegradación mediada por bacterias para elaborar nuevas estrategias eficientes de bioremediación.

En la primera línea de investigación, utilizamos bacterias del género Pseudomonas como sistema modelo. La bacteria colonizadora de la raíz Pseudomonas putida es nuestro modelo para analizar los mecanismo implicados en las interacciones planta-microrganismo en la rizosfera, tales como el desarrollo de biopelículas durante la colonización de la raíz, la respuesta quimiotáctica hacia exudados de raíz como aminoácidos e intermediarios del ciclo de Krebs, o los procesos de señalización entre las bacterias o con la planta. Nuestro objetivo es desentrañar el papel que juegan algunos determinantes de superficie tales como los exopolisácaridos, las adhesinas y otras proteínas extracelulares en distintos estilos de vida bacteriano (planctónico y sésil), así como profundizar en el papel que los niveles y la transducción de un segundo mensajero como el diguanilato cíclico desempeñan en la modulación de la transición entre estos estilos de vida. El patógeno oportunista Pseudomonas aeruginosa es nuestro modelo para analizar interacciones patógeno-huésped, especialmente aquellas interacciones necesarias durante el proceso de infección, con el objetivo final de encontrar nuevos compuestos antimicrobianos que bloqueen dichas interacciones y por tanto la virulencia de la bacteria. Utilizando estas dos especies de Pseudomonas, estamos analizando los distintos mecanismos mediante los cuales las bacterias perciben las señales ambientales y del huésped, lo que incluye rutas quimiosensoras, sistemas de uno y dos componentes, y sistemas de señalización de superficie celular (‘cell-surface signalling’). Estos mecanismos de transducción de señales modulan importantes funciones bacterianas, como quimiotaxis, formación de biopelículas, respuestas a estrés, asimilación de hierro, virulencia, y síntesis y degradación de antibióticos. Identificar las señales que definen las distintas características de la fisiología bacteriana y como éstas interaccionan con sus proteínas sensoras, son requisito imprescindible para muchas aplicaciones biotecnológicas.
Nuestro trabajo en el campo de la biodegradación se dirige especialmente a los hidrocarburos aromáticos mono- y policíclicos, los nitroaromáticos y los compuestos aromáticos policlorados, así como a los pesticidas, entre otros, buscando encontrar nuevas rutas de degradación tanto aerobias como anaerobias de estos compuestos, identificar sus determinantes genéticos así como los mecanismos moleculares que controlan su expresión. Nuestros objetivos incluyen la construcción de cepas mejoradas mediante ingeniería metabólica, y el análisis molecular de las enzimas de las rutas y las proteínas reguladoras. Utilizando aproximaciones metagenómicas, también estamos interesados en estudiar la diversidad bacteriana de sitios contaminados y no contaminados, para investigar la respuesta de las comunidades bacterianas a los cambios en su entorno y explorar su uso como fuente de nuevas actividades con relevancia biotecnológica.
Las aplicaciones potenciales de nuestra investigación son el control biológico de patógenos, la eliminación de contaminantes y la fitorremediación.
Laboratorios de investigación:

Amiloides: explotación en agricultura sostenible y seguridad alimentaria: anamfe@eez.csic.es



Líneas de investigación

Biorremediación, Rizorremediación y Biología Molecular de Pseudomonas de Interés en Protección Vegetal


Personal
Jefe de Grupo
Datos Personales


Nombre: SILVIA
Apellidos: MARQUÉS MARTÍN
Email: silvia.marques@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 285
Extensión VoIP CSIC: 180285
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Investigador Cientifico Del Csic
Web Personal:
MARQUÉS MARTÍN, SILVIA  E.Investigador Cientifico Del Csic

Jefe de Grupo
Datos Personales


Nombre: JUAN LUIS
Apellidos: RAMOS MARTÍN
Email: juanluis.ramos@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 326
Extensión VoIP CSIC: 180326
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Profesores Invest.Consejo Sup.Invest.Cientificas -Csic-
Web Personal:
RAMOS MARTÍN, JUAN LUIS  E.Profesores Invest.Consejo Sup.Invest.Cientificas -Csic-

Datos Personales


Nombre: REGINA-MICHAELA
Apellidos: WITTICH
Email: rwittich@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 138/321
Extensión VoIP CSIC: 180138/321
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Profesores Invest.Consejo Sup.Invest.Cientificas -Csic-
Web Personal:
WITTICH, REGINA-MICHAELA  E.Profesores Invest.Consejo Sup.Invest.Cientificas -Csic-
Datos Personales


Nombre: TINO
Apellidos: KRELL
Email: tino.krell@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 294
Extensión VoIP CSIC: 180294
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Investigador Cientifico Del Csic
Web Personal: http://krell-laboratory.com/
KRELL, TINO  E.Investigador Cientifico Del Csic
Datos Personales


Nombre: ANA
Apellidos: SEGURA CARNICERO
Email: ana.segura@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 303
Extensión VoIP CSIC: 180303
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Investigador Cientifico Del Csic
Web Personal:
SEGURA CARNICERO, ANA  E.Investigador Cientifico Del Csic
Datos Personales


Nombre: ESTRELLA
Apellidos: DUQUE MARTÍN DE OLIVA
Email: estrella.duque@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 292/106
Extensión VoIP CSIC: 180292/106
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Cientificos Titulares Del Csic
Web Personal:
DUQUE MARTÍN DE OLIVA, ESTRELLA  E.Cientificos Titulares Del Csic
Datos Personales


Nombre: MANUEL
Apellidos: ESPINOSA URGEL
Email: manuel.espinosa@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 132
Extensión VoIP CSIC: 180132
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Cientificos Titulares Del Csic
Web Personal: http://www.sociomicrobiologia.es
ESPINOSA URGEL, MANUEL  E.Cientificos Titulares Del Csic
Datos Personales


Nombre: MARIBEL
Apellidos: RAMOS GONZÁLEZ
Email: maribel.ramos@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 116/248
Extensión VoIP CSIC: 180116/248
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Cientificos Titulares Del Csic
Web Personal: http://www.sociomicrobiologia.es
RAMOS GONZÁLEZ, MARIBEL  E.Cientificos Titulares Del Csic
Datos Personales

Nombre: PIETER
Apellidos: VAN DILLEWIJN
Email: pieter.vandillewijn@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 115/106
Extensión VoIP CSIC: 180115/106
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Cientificos Titulares Del Csic
Web Personal:
VAN DILLEWIJN, PIETER  E.Cientificos Titulares Del Csic
Datos Personales


Nombre: NENÉ
Apellidos: MOLINA HENARES
Email: nene.molina@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 267
Extensión VoIP CSIC: 180267
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Tec.Especialistas De Grado Medio De Oo.Publicos De Invest.
Web Personal:
MOLINA HENARES, NENÉ  E.Tec.Especialistas De Grado Medio De Oo.Publicos De Invest.
Datos Personales


Nombre: JESÚS
Apellidos: DE LA TORRE ZÚÑIGA
Email: jesus.delatorre@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 106
Extensión VoIP CSIC: 180106
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Ayudantes De Invest. De Los Oo.Publicos De Investigacion
Web Personal:
DE LA TORRE ZÚÑIGA, JESÚS  E.Ayudantes De Invest. De Los Oo.Publicos De Investigacion
Datos Personales


Nombre: MARIAN
Apellidos: LLAMAS LORENTE
Email: marian.llamas@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 309 / 291
Extensión VoIP CSIC: 180309 / 291
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: Inv. Cont. - Ramon y Cajal
Web Personal:
LLAMAS LORENTE, MARIAN  Inv. Cont. - Ramon y Cajal
Datos Personales


Nombre: MIGUEL ÁNGEL
Apellidos: MATILLA VÁZQUEZ
Email: miguel.matilla@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 118
Extensión VoIP CSIC: 180118
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: Inv. Cont. - Juan de la Cierva
Web Personal:
MATILLA VÁZQUEZ, MIGUEL ÁNGEL  Inv. Cont. - Juan de la Cierva
Datos Personales

Nombre: MATILDE
Apellidos: FERNANDEZ RODRIGUEZ
Email: matilde.fernandez@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 266
Extensión VoIP CSIC: 180266
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: Investigador Contratado
Web Personal:
FERNANDEZ RODRIGUEZ, MATILDE  Investigador Contratado
Datos Personales

Nombre: VICTOR
Apellidos: GARCIA TAGUA
Email: victor.tagua@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 248
Extensión VoIP CSIC: 180248
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: Investigador Contratado
Web Personal:
GARCIA TAGUA, VICTOR  Investigador Contratado
Datos Personales

Nombre: NOEL
Apellidos: MESA TORRES
Email: noel.mesa@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 321
Extensión VoIP CSIC: 180321
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: Investigador Contratado
Web Personal:
MESA TORRES, NOEL  Investigador Contratado
Datos Personales


Nombre: ALVARO
Apellidos: ORTEGA RETUERTA
Email: alvaro.ortega@csic.es
Extensión Telefónica: 118
Extensión VoIP CSIC: 180118
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: Inv. Cont. - JAE-DOC
Web Personal: http://krell-laboratory.com
ORTEGA RETUERTA, ALVARO  Inv. Cont. - JAE-DOC
Datos Personales

Nombre: LUIS IGNACIO
Apellidos: GUTIÉRREZ RUS
Email: luis.gutierrez@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 291
Extensión VoIP CSIC: 180291
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Becario
Categoría: Investigador En Practicas
Web Personal:
GUTIÉRREZ RUS, LUIS IGNACIO  Investigador En Practicas
Datos Personales

Nombre: LAZARO
Apellidos: MOLINA DELGADO
Email: lazaro.molina@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 266
Extensión VoIP CSIC: 180266
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: Investigador En Practicas
Web Personal:
MOLINA DELGADO, LAZARO  Investigador En Practicas
Datos Personales


Nombre: JOSÉ MIGUEL
Apellidos: QUESADA PÉREZ
Email: jose.quesada@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 291
Extensión VoIP CSIC: 180291
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: Investigador En Practicas
Web Personal:
QUESADA PÉREZ, JOSÉ MIGUEL  Investigador En Practicas
Datos Personales

Nombre: SILVIA MARINA
Apellidos: BLANCO MOYA
Email: silvia.blanco@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 106
Extensión VoIP CSIC: 180106
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: Titulado Superior De Investigacion Y Laboratorio
Web Personal:
BLANCO MOYA, SILVIA MARINA  Titulado Superior De Investigacion Y Laboratorio
Datos Personales

Nombre: ABDELALI
Apellidos: DADDAOUA
Email: abdelali.daddaoua@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 266
Extensión VoIP CSIC: 180266
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Laboral
Categoría: Titulado Superior Con Grado De Doctor
Web Personal:
DADDAOUA, ABDELALI  Titulado Superior Con Grado De Doctor
Datos Personales


Nombre: CRISTINA
Apellidos: CIVANTOS JIMENEZ
Email: cristina.civantos@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 291
Extensión VoIP CSIC: 180291
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
Web Personal:
CIVANTOS JIMENEZ, CRISTINA  TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
Datos Personales

Nombre: ANA ISABEL
Apellidos: GARCÍA GARCÍA
Email: anaisabel.garcia@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 118
Extensión VoIP CSIC: 180118
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: TECNICO SUPERIOR DE GEST. Y SERV. COMUNES
Web Personal:
GARCÍA GARCÍA, ANA ISABEL  TECNICO SUPERIOR DE GEST. Y SERV. COMUNES
Datos Personales

Nombre: ALICIA
Apellidos: GARCIA PUENTE
Email: alicia.garcia@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 266
Extensión VoIP CSIC: 180266
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Web Personal:
GARCIA PUENTE, ALICIA  TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Datos Personales

Nombre: PATRICIA
Apellidos: MARÍN QUERO
Email: patricia.marin@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 280
Extensión VoIP CSIC: 180280
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Web Personal:
MARÍN QUERO, PATRICIA  TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Datos Personales


Nombre: MARÍA ANGUSTIAS
Apellidos: REYES FRANCO
Email: mariangustias.reyes@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 110
Extensión VoIP CSIC: 180110
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Laboral
Categoría: TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Web Personal:
REYES FRANCO, MARÍA ANGUSTIAS  TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Datos Personales


Nombre: MARÍA LUISA
Apellidos: TRAVIESO HUERTAS
Email: mluisa.travieso@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 248
Extensión VoIP CSIC: 180248
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Laboral
Categoría: TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Web Personal: http://www.sociomicrobiologia.es/
TRAVIESO HUERTAS, MARÍA LUISA  TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Datos Personales

Nombre: LAURA MARIA
Apellidos: BARRIENTOS MORENO
Email: laura.barrientos@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 267
Extensión VoIP CSIC: 180267
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: Becari@ Predoctoral
Web Personal:
BARRIENTOS MORENO, LAURA MARIA  Becari@ Predoctoral
Datos Personales

Nombre: OSCAR
Apellidos: HUERTAS ROSALES
Email: oscar.huertas@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 267
Extensión VoIP CSIC: 180267
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Becario
Categoría: Becari@ Predoctoral
Web Personal: http://lastupidezestremendamentmasinteresant.blogspot.com.es/
HUERTAS ROSALES, OSCAR  Becari@ Predoctoral
Datos Personales

Nombre: DAVID
Apellidos: MARTIN MORA
Email: david.martin@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 118
Extensión VoIP CSIC: 180118
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Becario
Categoría: Becari@ Predoctoral
Web Personal:
MARTIN MORA, DAVID  Becari@ Predoctoral
Datos Personales

Nombre: JOAQUÍN RODRIGO
Apellidos: OTERO ASMAN
Email: joaquin.otero@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 291
Extensión VoIP CSIC: 180291
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Becario
Categoría: Becari@ Predoctoral
Web Personal:
OTERO ASMAN, JOAQUÍN RODRIGO  Becari@ Predoctoral
Datos Personales

Nombre: DANIEL
Apellidos: PACHECO SANCHEZ
Email: daniel.pacheco@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 280
Extensión VoIP CSIC: 180280
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Becario
Categoría: Becari@ Predoctoral
Web Personal:
PACHECO SANCHEZ, DANIEL  Becari@ Predoctoral
Datos Personales


Nombre: MÍRIAM
Apellidos: RICO JIMÉNEZ
Email: miriam.rico@eez.csic.es
Extensión Telefónica: 118
Extensión VoIP CSIC: 180118
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Becario
Categoría: Becari@ Predoctoral
Web Personal:
RICO JIMÉNEZ, MÍRIAM  Becari@ Predoctoral

Proyectos

Publicaciones ConCiencia

Publicaciones 2007-2011

Tesis

Publicaciones Anteriores

Plan de Calidad Ambiental de Andalucía


Colección de Cultivos Tipo Pseudomonas


La EEZ posee uno de los más importantes colecciones en el área de la biorremediación, la Colección de Cultivos Tipo Pseudomonas. A través de la página web artemisa.eez.csic.es/prcc/, pone a disposición de la comunidad científica las cepas requeridas. Este servicio tiene por objetivo la conservación de la colección de cultivos tipo Pseudonoma y la gestión de un banco de mutantes. Hasta la fecha, la financiación proviene de Acciones Especiales del Ministerio de Educación y Ciencia y del CSIC. Ha suministrado cepas de manera gratuita a grupos de todo el mundo. No obstante, a partir del 1 de mayo de 2005 se establece un canon de suministro de 100€. Además, se han creado otros fondos materiales para ofrecer servicios externos entre los que se incluyen la generación sistematizada de mutantes y la creación de un sistema selectivo de aislamiento de clones mutantes.